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個人簡介
程賽鳳，湖北孝感人。2007年就讀于華中農業大學生命科學與技術基地班，本碩博連讀后于2017年獲得華中農業大學生物化學與分子生物學博士學位，主要研究轉錄因子和表觀修飾在水稻頂端分生組織發育中的調控作用。2018-2023年在以色列威茲曼科學研究所進行博士后研究，研究方向為小鼠胚胎發育過程中DNA甲基化調控細胞命運決定的作用機制。博士后期間獲得EMBO Long-Term Fellowship。于2024年入職西湖大學生命科學學院，任特聘研究員、博士生導師。
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學術成果及研究方向
多細胞生物內具有相同基因組的細胞如何分化成形態、結構和功能不同的細胞類群是生物學領域的一個基本研究問題。一方面，細胞分化由細胞內在的轉錄水平和表觀修飾水平決定；另一方面，這一過程也受到細胞與細胞之間相互作用的影響，并且這兩類調控因子均隨著時間的推移而變化。因此，當我們研究細胞分化的調控機理，尤其是那些具有廣泛效應的作用機制（例如表觀遺傳調控）時，必須要在不同的發育時期內，將基因的直接效應（自主性效應）與由于其他細胞類型中信號轉導累積而來的間接效應（非自主性效應）區分開來。
小鼠胚胎發育是研究細胞命運決定的重要模型。在此過程中，DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質空間結構等表觀修飾經歷了劇烈的重編程。通過對不同程度的嵌合體胚胎的轉錄組分析，結合基于時間的細胞分化圖譜，程賽鳳博士證實，DNA去甲基化對原腸胚時期的大多數細胞分化程序來說是非必需條件，且DNA去甲基化更傾向于在全基因組范圍內微調基因的表達，而非傳統觀點認為的指導性作用。該研究也提供了一套解析胚胎發育時期基因功能的方法，使得我們能夠有效區分基因的自主效應與非自主效應。
這一發現也促使我們重新審視各種表觀修飾在細胞分化中的作用。為了深入研究這一問題，課題組將以小鼠胚胎發育為研究對象，綜合運用單細胞轉錄組、囊胚注射、基因編輯等技術，結合體內和體外模型，研究：（1）組蛋白修飾在早期細胞命運決定中的作用；（2）順式作用元件調控細胞分化的機理；（3）表觀修飾在胚外譜系發育及胚外譜系與胚胎譜系相互作用中的調控機理。
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代表論文
* These authors contributed equally，#?Co-correspondence
1. Yoav Mayshar*, Ofir Raz*, Saifeng Cheng, Raz Ben-Yair, Ron Hadas, Netta Reines, Markus Mittnenzweig, Oren Ben-Kiki, Aviezer Lifshitz, Amos Tanay#, Yonatan Stelzer#. (2023). Time-aligned hourglass gastrulation models in rabbit and mouse. Cell?186, 2610-2627.e18. 10.1016/j.cell.2023.04.037.
2. Marko Dunji?*, Felix Jonas*, Gilad Yaakov*, Roye More, Yoav Mayshar, Yoach Rais, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Saifeng Cheng, Naama Barkai, Yonatan Stelzer.?(2023). Histone exchange sensors reveal variant specific dynamics in mouse embryonic stem cells. Nat Commun?14, 1–19. 10.1038/s41467-023-39477-3.
3. Saifeng Cheng, Yoav Mayshar, Yonatan Stelzer. (2023). Induced epigenetic changes memorized across generations in mice. Cell?186, 683–685. 10.1016/j.cell.2023.01.023.
4. Saifeng Cheng*, Markus Mittnenzweig*, Yoav Mayshar, Aviezer Lifshitz, Marko Dunji?, Yoach Rais, Raz Ben-Yair, Stephanie Gehrs, Elad Chomsky, Zohar Mukamel, Hernan Rubinstein, Katharina Schlereth, Netta Reines, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Amos Tanay#, Yonatan Stelzer#. (2022). The intrinsic and extrinsic effects of TET proteins during gastrulation. Cell?185, 3169-3185.e20.
5. Markus Mittnenzweig*, Yoav Mayshar*, Saifeng Cheng, Raz Ben-Yair, Ron Hadas, Yoach Rais, Elad Chomsky, Netta Reines, Anna Uzonyi, Lior Lumerman, Aviezer Lifshitz, Zohar Mukamel, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Amos Tanay#, Yonatan Stelzer#. (2021). A single-embryo, single-cell time-resolved model for mouse gastrulation. Cell?184, 2825-2842.e22. 10.1016/j.cell.2021.04.004.
6. Alejandro Aguilera-Castrejon*, Bernardo Oldak*, Tom Shani, Nadir Ghanem, Chen Itzkovich, Sharon Slomovich, Shadi Tarazi, Jonathan Bayerl, Valeriya Chugaeva, Muneef Ayyash, Shahd Ashouokhi, Daoud Sheban, Nir Livnat, Lior Lasman, Sergey Viukov, Mirie Zerbib, Yoseph Addadi, Yoach Rais, Saifeng Cheng, Yonatan Stelzer, Hadas Keren-Shaul, Raanan Shlomo, Rada Massarwa, Noa Novershtern, Itay Maza#, Jacob H Hanna#. (2021). Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis. Nature?593, 119–124. 10.1038/s41586-021-03416-3.
7. Saifeng Cheng, Feng Tan, Yue Lu, Xiaoyun Liu, Tiantian Li, Wenjia Yuan, Yu Zhao, Dao-Xiu Zhou. (2018). WOX11 recruits a histone H3K27me3 demethylase to promote gene expression during shoot development in rice. Nucleic Acids Res?46, 2356–2369. 10.1093/nar/gky017.
8. Shaoli Zhou,Wei Jiang, Fei Long, Saifeng Cheng, Wenjing Yang, Yu Zhao, and Dao-Xiu Zhou. (2017). Rice Homeodomain Protein WOX11 Recruits a Histone Acetyltransferase Complex to Establish Programs of Cell Proliferation of Crown Root Meristem. Plant Cell?29, 1088–1104. 10.1105/tpc.16.00908.
9. ?Yu Zhao*, Saifeng Cheng*, Yaling Song, Yulan Huang, Shaoli Zhou, Xiaoyun Liu, Dao-Xiu Zhou. (2015). The Interaction between Rice ERF3 and WOX11 Promotes Crown Root Development by Regulating Gene Expression Involved in Cytokinin Signaling. Plant Cell?27, 2469–2483. 10.1105/tpc.15.00227.
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https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=rYfo4WcAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate?
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